在美丽的夜景下，上海中心、金茂大厦、上海环球金融中心鳞次栉比。凌驾于那些超高层建筑群的巨大的黑色金字塔，还在继续释放着像等离子一样的波动。
在地面上，卡蜜拉和达拉姆、希特拉带着半陶醉的表情沐浴在那波动之中。当达拉姆和希特拉就像饥饿的野兽那样咬住卡蜜拉取出的暗红色结晶体时，两人的额头被切裂，发黑的水晶出现了。从那里喷出的黑暗笼罩着两人的身体，变化为让人联想到奥特曼装甲的甲胄。在前几天被诸星切断的希特拉的右臂上，桡骨和尺骨照原样伸长，生长出长而锐利的爪子，在那之间张开着突然裂开的黑色窟窿。
旋转灯转动、警报器鸣响。Z-19攻击直升机的转动声音越来越近。街道上正在集结着03B式装甲车和满载武装人员的军用卡车。卡蜜拉等黑暗三人组，很快就被JS9冲锋枪的枪口群包围了。
面对站在金字塔顶端的邪恶迪迦，一架直升机向他打出探照灯并同时发出多种语言的警告。邪恶迪迦只是像被激怒一样地单手发射了光弹。被光弹贯穿的直升机失去控制而坠落，撞上了东方明珠电视塔。
以此为信号，武警展开了对金字塔和邪恶迪迦、黑暗三人组的攻击。但是子弹和导弹都没有明显的效果，或被弹开，或被偏离，这只是进一步扩大了损失。在没有任何避难和封锁的情况下，到处都是平民和游客的上海街道，转眼间变成悲鸣和枪声、劫火和流血的漩涡。
“染上、黑暗吧。”
在邪恶迪迦的命令下，就像聚集在外灯下的羽虫散开一样，来自黑色金字塔表面的成群的异界兽飞向四面八方。是小型的佐加。佐加聚集在四处逃窜的人群和士兵身上，吃得到处都是。有时自己跳入牺牲者的口中，变成了异界兽。他们潜入到建筑物和车辆、船舶、地下街道、水中，不分男女老少地吃得津津有味。
邪恶迪迦举起右臂上的Evil Folk（イーヴィルフォーク）、伸出两把光刃后使其振动。这是直接攻击大脑的技能——Evil Resonance（イーヴィル·レゾナンス）。但是，其威力和效果半径相差悬殊。在四处逃窜的幸存者被剧痛折磨得喘不过气来的情况下，有人摇身一变成为与佐加不同的异形。也就是说，混进群众中的外星人的拟态解开了。上海是东亚最大的外星人街之一。
在金字塔的顶端睥睨地看着燃烧的街道，脖子向右、向左转的邪恶迪迦通过佐加的感觉器官，好像是在寻找着什么，或者是谁。
“地狱啊！”
面对着上海的极度惨状，井手无法将脸从屏幕上移开。
“这就是他们的目的吗？创造出这个地狱！”
就连冷静沉着的诸星也咬紧牙关。
“不，这只是一种手段。”
大家的视线都集中在幽怜身上，看着那张与年幼的外表不相称的，充满着深深的忧郁的少女的脸。
“如果邪神加坦杰厄（ガタノゾーア）觉醒的话，这个世界会在瞬间灭亡，就像我们的世界一样。”
“加坦杰厄？”
听到一连串生疏的声音，北斗不由得反问道。
“旧日支配者——在宇宙的若干文明中留下痕迹，是君临于遥远的超古代的高度异质的生命体的名称。当然，对地球人来说不可能有正确的发音。”
芝顿星人艾德捉摸着。
“请想起。封印的标记。”
按照幽怜的话，井手把封印的纹样传到屏幕上。
“5个封印已被解除。剩下的是那个中心、异界之门的封印。”
在大古指着的纹样的中心，画着眼睛、或者是看起来像火焰的图形。
“大门的解封需要〈钥匙〉。象征着眼睛的、巨大的力量。他们寻找的就是那个。”
“有什么线索吗？在这个世界的钥匙、庞大的眼睛。”
井手追溯着记忆。以眼睛作为力量象征的文化还有很多。荷鲁斯之眼。瓦吉特之眼。普罗维登斯之眼。但是、在上海应该找的眼睛是……。
啪！井手用掌底拍打自己的太阳穴。
“鲁伯亚星人（ルボイア星人）！拥有占体重60%以上的眼球和空间连接能力的外星人！”
井手的手指高速敲击着键盘。屏幕上显示出了像是从眼球里长出手脚的鲁伯亚星人的容貌和登记信息。
“在管理局登记过的有一个符合条件，住在上海外星人居住中心！”
没错。必须尽快保护他，阻止大门的开封。
“如果做不到会怎么样？这个眼球小子被敌人夺去的情况是？这可不是签证快递。不能以‘迟到了就不收钱了’去解决。”
诸星的指摘是合理的。距离东京1760公里的上海实在太远了。
“……我有个办法。”
幽怜的表情说明，那个办法什么的不是那么容易就能办到的。
“……我明白了。”
也许是察觉到决心，诸星也不再追究了。
“恐怕是那个黑色奥特曼……不、是叫<邪恶迪迦>吗？可能还要对付那个家伙和那个三人组吧。另外还有大量的异界兽的存在。虽然是伴随着危险的任务，能去吗？”
对于井手的最终确认，北斗和诸星两人作出回应。
“当然！”
“没问题。”
大家马上做好出动的准备。
“……咦？早田前辈呢？”
北斗环顾室内。
“这么说来，他还没回来呢。”
井手担心地说。
“那家伙也不在。”
诸星所说的那个家伙，是指直到刚才还在一块的大古。
似乎是在大家被屏幕上放映的上海异样的景象——漆黑的金字塔夺去注意力时出去的。
“我们马上去找他们两个。”
“不。”
北斗的话被诸星打断了。
“现在没有那个时间。”
“……是啊。确实刻不容缓。”
井手点了点头。
“诸星君和北斗君先去上海，保护鲁伯亚星人。”
诸星和北斗点了点头，奔向机库。
“但是，进次郎君，你到底怎么了？”
面对井手的嘟囔，艾德沉默无言。
在一旁的幽怜注视着屏幕、喃喃说道。
“最可怕的黑暗是在人的心中。”
黑夜——。科特队基地主楼的屋顶。四周已经变得漆黑，而进次郎还跪在地上一动不动。
脑中浮现的强烈幻象挥之不去。
“……我……”
幻象再次袭来。
黑暗的神殿中，火柱腾起，金字塔耸立着。
是奥特曼。漆黑的，奥特曼。
周围的血海越来越宽，人们倒在地上，痛苦地挣扎。
“哼！”
随着漆黑的奥特曼低沉的一声，那些人就被光波撕裂。
悲鸣四起。血肉横飞。
“你们是祭品。用你们的血，用你们的肉，打开异界之门。”
被一个个居杀的祭品之中。出现了香奈枝的身影。
“……谢谢你。……奥特曼。”
光波把微笑着的香奈枝一分为二。
——住手。住手。……住手啊！
进次郎吼叫着回头看着漆黑的奥特曼。
“让我住手？为什么？这不是你盼望的吗？”
——我？
进次郎茫然地重复着。然后，
“因为，你，就是我。”
漆黑的奥特曼的头盔打开了，